Tuberkulosiaren diagnostikorako eta drogen aurkako detekziorako arma berria: belaunaldi berri bat zuzendutako sekuentziazioa (TNGS) tuberkulosiaren hipersentsibilitatearen diagnostikoarekin batera
Literatura Txostena: CCA: TNGS eta Makina ikasteko oinarritutako diagnostiko eredua, hau da, bakterio gutxiago duten tuberkulosia eta meningitis tuberkulosia duten pertsonentzat egokia da.
Tesiaren izenburua: Tuberkulous-zuzendutako hurrengo belaunaldiko sekuentziazioa eta makina ikastea: diagnostiko handiko estrategia puxu puitsikoko biriketako tubularretarako eta meningitis tubularretarako.
Periodikoa: "Klinika Chimica Acta"
If: 6,5
Argitalpenaren data: 2024ko urtarrila
Capital of Sciences-eko Unibertsitatearekin eta Beijing-eko Kapitaleko Unibertsitateko Unibertsitatearekin konbinatuta, Macro eta Micro-Test-ek tuberkulosia diagnostikoko eredua ezarri zuen, zuzendutako sekuentziazioen eta makinen ikasteko metodoaren belaunaldi berrian oinarrituta. Bakterio gutxirekin tuberkulosiaren sentikortasuna detekzioa bakterio gutxirekin eta meningitisa tuberkulosoekin, bi motatako diagnostiko klinikorako hipersentsibilitate metodo berria eman zuen Tuberkulosia, eta diagnostiko zehatza, drogen erresistentzia tuberkulosiaren detekzioa eta tratamendua lagundu zituen. Aldi berean, gaixoaren plasma CFDNA laginketa klinikoko lagin klinikoetarako lagin mota egoki gisa erabil daitekeela da TBM diagnostikoan.
Azterketa honetan, 227 plasma laginak eta fluxu lizentzialeko laginak bi kohorte kliniko ezartzeko erabili ziren, eta bertan laborategiko diagnostikoko kohorte laginak erabili ziren makina ikasteko tuberkulosiaren diagnostikoaren eredua ezartzeko eta ezarritako cohorte klinikoen laginak ezarritakoa egiaztatzeko erabili ziren Eredu diagnostikoa. Lagin guztiak mycobacterium tuberkulosiarentzako bereziki diseinatutako harrigarriko igerilekuarekin zuzenduta zeuden. Ondoren, TB-TNGS sekuentziazio-datuetan oinarrituta, erabaki zuhaitzaren eredua laborategiko diagnostikoaren prestakuntza eta balioztatze multzoetan 5 aldiz zeharkako balioztapena egiteko erabiltzen da eta plasma laginen eta fluido zerebrospinal laginen atalase diagnostikoak lortzen dira. Lortutako atalasea detekziorako diagnostiko klinikoko ilaran bi proba multzotan sartzen da eta ikasten diagnostikoaren errendimendua ROC Curve-k ebaluatzen du. Azkenik, tuberkulosiaren diagnostiko eredua lortu zen.
Ikerketa diseinuaren diagrama eskematikoa
EMAITZAK: CSF DNA laginaren (AUC = 0.974) eta Plasma CFDNA lagina (AUC = 0,908) arabera, 227 laginen artean zehazten da, CSF laginaren sentsibilitatea% 97,01koa izan zen, eta espezifikazioa% 95,65 izan zen eta Plasmaren laginaren sentsibilitatea eta berezitasuna% 82,61 eta% 86,36 izan ziren. TBM pazienteetako 44 plasma-ko dna gibeleko 44 laginak aztertzean, ikerketa honen diagnostiko estrategiak% 90,91 (40/44) koherentzia handia du Plasma CFDNAn eta Cerebrospinal Fluid DNAren% 95,45 da. (42/44). Biriketako tuberkulosia duten haurrengan, azterketa honen estrategia diagnostikoa sentikorragoa da paziente berekoak diren pazienteen laginak baino plasma laginak baino paziente berekoak (% 28,57 vs% 15,38).
2. irudia. Biztanleriaren laginetarako tuberkulosiaren diagnostiko ereduaren azterketa
3. irudia. Parekatutako laginen emaitza diagnostikoak
Ondorioa: Tuberkulosiaren diagnostiko metodo hipersentsiboa ezarri zen ikerketa honetan, eta horrek diagnostiko tresna bat eman dezake paziente klinikoetarako hautemateko sentsibilitate handiena duten paziente klinikoetarako (kultura negatiboa). Plasma CFDNAn oinarritutako tuberkulosia hipersentsiboak detektatzea tuberkulosia aktiboa eta tuberkulosoko meningitisa diagnostikatzeko lagin mota egokia izan daiteke (plasma laginak errazagoak dira garuneko tuberkulosia susmatzen zuten gaixoentzako fluido zerebrospinala baino.
Jatorrizko esteka: https://www.scientecirect.com/science/article/pii/s0009898123004990? % 3Dihub bidez
Makro eta mikro-probaren sarrera laburra Tuberkulosiaren serieak hautemateko produktuak
Tuberkulosiaren laginaren egoera konplikatua eta hainbat behar, makro eta mikro-testak NGS irtenbide multzo osoa eskaintzen du Sputum laginak, Qualcomm liburutegiko eraikuntza eta sekuentziazioa eta datuen analisia. Produktuek tuberkulosiaren pazienteen diagnostiko azkarra, tuberkulosiaren detekzioaren detekzio azkarra estaltzen dute, mycobacterium tuberkulosia idaztea eta NTM, bakterioen tuberkulosia eta tuberkulosoak eta abar.
Tuberkulosia eta mikorjeria serieko hautemateko kitak:
| Elementua ez | Produktuaren izena | Produktuen proben edukia | Lagin mota | Aplikatzeko eredua |
| Hwts-3012 | Laginak askatzeko agentea | Sputum laginen likidotze tratamenduan erabilitakoak, lehen mailako erregistro zenbakia lortu du, Sutong Makineria Ekipamenduak 20230047. | puxuumo | |
| Hwts-ngs-p00021 | Qualcomm kantitatea detektatzeko kit tuberkulosi hipersentsiborako (zunda ateratzeko metodoa) | Ez-inbaditzaileak (biopsia likidoa) hipersentsibilitatea detekzioa bakterio negatiboak-biriketako tuberkulosia eta garuneko noduluak; Tuberkulosia edo tuberkulosia ez duten pertsonen laginak sekuentziazio sakonak sekuentziazio sakonak aztertu ziren eta tuberkulosia edo tuberkulosia ez den ala ez detekzioaren informazioa kutsatuta egon ziren eta mycobacterium tuberkulosiaren lehen lerroko erresistentziaren informazioa eman ziren. | Odol periferikoa, albeolar albeolar fluidoa, hydrothorax eta ascites, fokua zulatzeko lagina, fluido zerebrospinala. | Bigarren belaunaldia |
| Hwts-ngs-t001 | MyCobacterium Idazketa eta Drogaren Erresistentzia Detekzio Kit (multiplikazio anplifikazio sekuentziazio metodoa) | Mycobacterium Idazketa proba, MTBC eta 187 NTM barneIkaina;Mycobacterium tuberkulosiaren detekzioaren detekzioak 13 droga eta 16 nukleo erresistentziako geneak biltzen ditu. | Sputum, albeolar albeolar fluidoa, hydrothorax eta ascites, fokua zulatzeko lagina, fluido zerebrospinala. | Bigarren belaunaldiko plataforma bikoitza |
Nabarmentzekoak: HWTS-NGS-T001 Mycobacterium Idazketa eta Drogaren Erresistentzia hautemateko kit (multiplex anplifikazio metodoa)
Produktuaren aurkezpena
Produktua NTM tratamenduaren jarraibideetan normalean erabiltzen diren TB tratamendu jarraibideetan, makrolidoetan eta aminoglizesidoetan deskribatutako lehen mailako droga nagusietan oinarritzen da eta droga erresistentziako guneek drogen erresistentziarekin lotutako guneetako talde guztiak estaltzen dituzte Mycobacterium tuberkulosiaren mutazio katalogo konplexua, baita drogen erresistentzia geneak eta mutazio guneak ere, puntuazio handiko ikerketaren eta estatistiken arabera. Literaturak etxean eta atzerrian.
Idazteko identifikazioa NTM tuberkuluak Tuberkulosia eta arnas gaixotasunak eta adituen adostasunak argitaratutako NTMren jarraibideetan laburbildutako NTMren jarraibideetan oinarrituta dago. Diseinatutako idazketa nagusiek 190 NTM espezie baino gehiago anplifikatu, sekuentziatu eta ohar ditzakete.
Multiplex PCR anplifikazio teknologiaren bidez, Mycobacterium-en genotiping geneak eta drogak erresistenteak diren pcr-en anplifikatu ziren. Produktu anplifikatuak bigarren belaunaldiko edo hirugarren belaunaldiko sekuentziazio handiko liburutegietan eraiki daitezke, eta bigarren belaunaldiko eta hirugarren belaunaldiko sekuentziazio plataforma guztiak sakonki sekuentziazio sakonak jasan ditzakete, xede geneen sekuentzia informazioa lortzeko. Integratutako erreferentziako datu-basean jasotako mutazioekin (mycobacterium tuberkulosia konplexua duten multation katalogoan eta drogen erresistentziarekin duen harremana barne), drogen aurkako erresistentziarekin edo tuberkulosiaren aurkako sendagarritasunarekin lotutako mutazioak zehaztu ziren. Makro eta mikro-probaren sputum laginaren tratamenduaren soluzioarekin konbinatuta, azido nukleiko baxuko eta azido nukleiko baxuko esputuaren lagin klinikoen eraginkortasuna (metodo tradizionalena baino hamar aldiz handiagoa) konpondu zen, beraz, droga erresistentziaren sekuentziazio sekuentziazioa detekzioa izan daiteke zuzenean aplikatutako sputum lagin klinikoetan.
Produktuak hautemateko tartea
34Droga erresistentziarekin lotutako geneak18tuberkulosiaren aurkako drogak eta6NTM drogak hauteman ziren, estaltzen297drogen erresistentzia guneak; Mycobacterium tuberkulosia mota eta gehiago190NTM mota hauteman ziren.
1. taula: 18 + 6 drogen informazioa + 190 + NTM
Produktuaren abantaila
Egokitasun kliniko sendoa: esputuaren laginak zuzenean hauteman daitezke auto-likidotze agentearekin kulturarik gabe.
Eragiketa esperimentala erraza da: anplifikazio operazioaren lehen txanda erraza da eta liburutegiaren eraikuntza 3 ordutan osatzen da, eta horrek lanaren eraginkortasuna hobetzen du.
Idazketa eta drogen erresistentzia integrala: MTB eta NTM-ren idazketa eta drogak erresistentziako guneak estaltzen dituzte.
Bateragarritasuna: produktuen bateragarritasuna, ILM nagusira eta MGI / Ont plataformetara egokituz.
Produktuen zehaztapena
| Produktuaren kodea | Produktuaren izena | Detekzio plataforma | zehaztapenak |
| Hwts-ngs-t001 | Mycobacterium Idazketa eta drogen erresistentzia hautemateko kit (multiplex anplifikazio metodoa) | Ont, Illumina, MGi, Salus Pro | 16 / 96RXN |
Ordua: 2012ko urtarrilak 23