Tuberkulosia diagnostikatzeko eta sendagaiekiko erresistentzia detektatzeko arma berri bat: Tuberkulosiaren hipersentsibilitatearen diagnostikorako ikaskuntza automatikoarekin konbinatutako sekuentziazio zuzendu berri bat (tNGS)
Literatur txostena: CCa: tNGS eta ikaskuntza automatikoan oinarritutako diagnostiko eredua, tuberkulosi bakteriano eta meningitis tuberkuloso gutxiago duten pertsonentzat egokia dena.
Tesiaren izenburua: Tuberkulosiari zuzendutako hurrengo belaunaldiko sekuentziazioa eta ikaskuntza automatikoa: biriketako hodi pauzifikoetarako eta meningitis tubularretarako diagnostiko estrategia ultrasentikorra.
Aldizkaria: 《Clinica Chimica Acta》
BALDIN BADA: 6.5
Argitalpen data: 2024ko urtarrila
Txinako Zientzien Unibertsitateko Akademiarekin eta Capital Medical Universityko Beijing Chest Hospital-ekin batera, Macro & Micro-Test-ek tuberkulosia diagnostikatzeko eredu bat ezarri zuen, sekuentziazio zuzenduaren (tNGS) teknologia berrian eta ikaskuntza automatikoaren metodoan oinarrituta. Eredu horrek detekzio-sentsibilitate ultra-altua eman zuen bakterio gutxiko tuberkulosia eta meningitis tuberkulosoa lortzeko, bi tuberkulosi motaren diagnostiko klinikorako hipersentsibilitate-diagnostiko metodo berri bat eskaini zuen, eta tuberkulosiaren diagnostiko zehatza, erresistentzia detekzioa eta tratamendua erraztu zituen. Aldi berean, ikusi da pazientearen plasmako cfDNA lagin mota egoki gisa erabil daitekeela TBM diagnostikoan lagin klinikoetarako.
Ikerketa honetan, 227 plasma lagin eta likido zefalorrakideo lagin erabili ziren bi kohorte kliniko ezartzeko, non laborategiko diagnostiko kohorte laginak tuberkulosia diagnostikatzeko ikaskuntza automatikoaren eredua ezartzeko erabili ziren, eta diagnostiko kliniko kohorte laginak ezarritako diagnostiko eredua egiaztatzeko. Lagin guztiak lehenik Mycobacterium tuberculosis-erako bereziki diseinatutako harrapaketa zunda multzo batekin zuzendu ziren. Ondoren, TB-tNGS sekuentziazio datuetan oinarrituta, erabaki-zuhaitz eredua erabili zen laborategiko diagnostiko ilararen entrenamendu eta balioztatze multzoetan 5 aldizko gurutzaketa balidazioa egiteko, eta plasma laginen eta likido zefalorrakideo laginen diagnostiko atalaseak lortu ziren. Lortutako atalasea diagnostiko kliniko ilararen bi proba multzotan sartzen zen detekziorako, eta ikaslearen diagnostiko errendimendua ROC kurbaren bidez ebaluatzen zen. Azkenik, tuberkulosiaren diagnostiko eredua lortu zen.
1. irudia Ikerketa-diseinuaren eskema-diagrama
Emaitzak: Ikerketa honetan zehaztutako LKE DNA laginaren (AUC = 0,974) eta plasma cfDNA laginaren (AUC = 0,908) atalase espezifikoen arabera, 227 laginen artean, LKE laginaren sentikortasuna % 97,01ekoa izan zen, espezifikotasuna % 95,65ekoa, eta plasma laginaren sentikortasuna eta espezifikotasuna % 82,61 eta % 86,36koak. TBM duten pazienteen plasma cfDNA eta likido zefalorrakideoko DNAren 44 lagin parekaturen analisian, ikerketa honen diagnostiko-estrategiak % 90,91eko (40/44) koherentzia handia du plasma cfDNA eta likido zefalorrakideoko DNAn, eta sentikortasuna % 95,45ekoa da (42/44). Biriketako tuberkulosia duten haurrengan, ikerketa honen diagnostiko-estrategia sentikorragoa da plasma laginekiko paziente berdinen urdaileko zuku laginen Xpert detekzio-emaitzekin alderatuta (% 28,57 VS % 15,38).
2. irudia: Tuberkulosiaren diagnostiko ereduaren analisi errendimendua populazio laginetarako
